然而最高法院法官判決羅耀拉高中得直。法庭認為該校享有宗教自由，教育部部長拒絕其申請是不合理的做法，且粗暴踐踏了該校在憲法裡所享有的人權及宗教自由保障。

法庭亦認為，該校辦目的是弘校天主教教義的教育，而家長的意願亦一致，因此對該校教導「倫理及宗教」課加以限制是對宗教自由的嚴重干預。法庭的判詞更批評教育部的角色應倡導宗教共融，而不是消滅學校的宗教信仰，認為教育部的做法已是越位。

羅耀拉高中的申訴在上訴庭全遭駁回，但該校仍上告最高法院，結果全數七位法官裁定它們得直。

作為平機會前總平等機會主任束健銘指，有關學校為伸張其教義的原則，鍥而不捨地就信仰的實踐課題打美好的法律戰。當中有16個基督教組織以介入訴訟者身份參與訴訟，其中包括「維護家庭教育法律會」。

他寫道：它們(16個基督教組織)完全瞭解有關判決的重要性和『唇亡齒寒』的道理。

背景介绍：由于宪法的限制，加拿大联邦政府不能管理中小学教育。各省教学大纲和制度都不同。有半数省份对私立学校包括教会学校提供50%经费补助, 其中萨斯卡通省对部分基督教学校的学费补贴达到80%，而阿尔伯特省的部分基督教学校则包括在公立学校系统之内。另外，加拿大大部分省份都有独立的天主教教育局，各省对天主教学校补贴达到100%，等同于公立学校。